Часовня во имя Серафима Саровского Чудотворца и святителя Алексия у моста через Омь была возведена в 1907 году по инициативе настоятеля госпитальной церкви Алексея Васильевича Серебренникова. Автором ее проекта был академик архитектуры, генерал-майор технического управления Александр Иванович фон Гоген. Постройка, выполненная в неорусском стиле, представляла собой двухэтажный прямоугольный объем, увенчанный высоким шатром с луковичной главкой на тонкой шее. Краснокирпичное поле стен прорезали арочные проемы, оформленные килевидными наличниками. В интерьере часовни были установлены доски с именами погибших в русско-японскую войну воинов. Часовня была приписана к Скорбященской церкви при омском военном госпитале. Весь доход от продажи свечей, за исключением расходов на содержание часовни, поступал в пользу попечительства о семействах воинов, призванных из Акмолинской области на службу по случаю войны.
Летом 1927 года часовню постигла печальная участь многих храмов: она была снесена. Однако ей суждено было стать первым возрожденным из небытия памятником культового зодчества в Омске.
Идея восстановления этого утраченного памятника духовной культуры берет свое начало в 1980 году, когда известный художник и архитектор-проектировщик Виктор Александрович Десятов разрабатывал архитектурную часть проекта памятника Карою Лигети. Он предложил установить на месте разрушенной часовни памятный камень с ее изображением. В то время это предложение не было одобрено, но полностью увлекло самого проектировщика. В.А. Десятов стал собирать все материалы, относящиеся к теме часовни, и приступил к разработке проекта ее восстановления. Лишь в 1990 году идея Десятова получила поддержку на градостроительном совете.
28 мая 1992 года состоялась торжественная закладка здания. Все работы были проведены силами исключительно омских архитекторов, инженеров, строителей, мастеров. Даже крест и маковица часовни были покрыты сусальным золотом в Омске. 6 декабря 1994 года на берегу реки Оми состоялось освящение и торжественное открытие восстановленной Серафимо-Алексиевской часовни. Сейчас ее силуэт является одним из архитектурных символов нашего города.